• Réduire le texte

    Réduire le texte
  • Rétablir taille du texte

    Rétablir taille du texte
  • Augmenter le texte

    Augmenter le texte
  • Imprimer

    Imprimer
Tournage Inra Bordeaux-Aquitaine © Alain Girard - Inra

Communiqués et dossiers de presse

Sommaire
  1. Introduction
  2. L'Inra et ses partenaires ont inauguré deux infrastructures de recherche et d’innovation au service des filières Forêt-bois en Aquitaine
  3. La variabilité des séquences de l'ADN permet de prédire la vulnérabilité du Pin maritime face au changement climatique
  4. Inauguration d’un outil scientifique phare de la lutte contre le changement climatique : le réseau national Ecosystèmes-ICOS
  5. Un nouveau modèle évolutif du génome des conifères
  6. Inauguration de la serre de confinement à haute performance environnementale : un outil unique en France de recherche dans le domaine végétal
  7. Inauguration d’OptiNutriBrain: un laboratoire international à la recherche d’une alimentation optimale pour la santé du cerveau
  8. Le pin maritime rattrapé par un de ses champignons pathogènes : la distribution spatiale passée des forêts explique la répartition actuelle de la maladie dans les nouvelles plantations
  9. La survie du Pin maritime face au changement climatique ne dépend que partiellement de son hétérozygotie
  10. Les pistes d'adaptation de la viticulture et de la production de vin face au changement climatique
  11. Pour les mycoplasmes, la meilleure défense c’est l’attaque
  12. La recherche internationale mobilisée pour concevoir les forêts de demain
  13. Les acteurs recherche-développement de la filière forêt-bois renouvellent leur partenariat pour concevoir le futur du pin maritime en Nouvelle-Aquitaine
  14. L’Inra  et le Conseil régional d’Aquitaine signent une convention pluriannuelle de partenariat pour renforcer les capacités de recherche, de formation et d’innovation
  15. Des marqueurs génétiques pour garantir la traçabilité des bois de chêne de tonnellerie
  16. Saurez-vous répondre à l’appel des Bois ? L’Inra invite les scolaires et le grand public à partir à la découverte de ses recherches forestières
  17. En Aquitaine, la hêtraie du Ciron a résisté au temps et commence à livrer ses secrets…
  18. Pourquoi le cerveau a-t-il besoin des oméga 3 ?
  19. Dossier de presse : Concevoir les vergers de demain
  20. Le génome du chêne séquencé
  21. Callitris tuberculata : l’arbre le plus résistant du monde à la sécheresse

Le génome du chêne séquencé

Des équipes de recherche de l’Inra et du CEA viennent de séquencer le génome du chêne pédonculé (Quercus robur). Il s’agit du premier séquençage pour une espèce du genre Quercus très largement répandu dans l’hémisphère nord. Ces travaux permettront notamment de mieux comprendre les mécanismes d’adaptation des arbres aux variations environnementales et fourniront des éléments pour anticiper leurs réponses au changement climatique. Ils font l’objet d’un premier article publié dans la revue en libre accès Molecular Ecology Resources, avant une publication finalisée des résultats dans les prochains mois.

Publié le 11/05/2015
Mots-clés : PRESSE - DOSSIER
Arbre emblématique, le chêne pédonculé (Quercus robur) fait partie de la section botanique la plus importante du genre Quercus : les chênes blancs, dont on dénombre 200 espèces et qui sont présents à la fois en Europe, en Asie et en Amérique. Grâce à un consortium piloté par l’Inra de Bordeaux-Aquitaine, en partenariat avec le Centre National de Séquençage du CEA (Génoscope), le génome du chêne pédonculé vient d'être séquencé. Trois années de travaux ont permis de décrypter l'ensemble de l'information génétique portée par ses 12 paires de chromosomes. Le consortium a caractérisé 50 000 gènes et estimé que la moitié des 1,5 milliard de paires de base du génome était constituée d’éléments répétés. C’est la première réalisation pour une espèce du genre Quercus, qui occupe une place importante au plan économique, écologique, mais aussi culturel dans de nombreux pays. Séquençage Chêne pédonculé. © Inra, A. Kremer
Séquençage Chêne pédonculé © Inra, A. Kremer

Le séquençage du génome du chêne pédonculé constitue une porte d'entrée unique pour analyser et comprendre la fonction des gènes de cet arbre emblématique. Son génome aura ainsi valeur de référence pour les autres espèces de chênes blancs, mais également pour des espèces plus éloignées de la famille des Fagacées (Châtaignier ou Hêtre). Il permettra d’étudier la régulation interne des espèces très longévives exposées à de forte variations climatiques annuelles, voire à des événements extrêmes au cours de leur vie. Ces recherches faciliteront également l’identification des gènes impliqués dans l'adaptation à l'environnement ou dans les relations symbiotiques entre leurs racines et les champignons mycorhiziens (comme le mycélium de la truffe). Elles permettront aussi l’identification des gènes responsables de la biosynthèse des extractibles du bois, tels que les tannins et whisky lactone, qui confèrent leur saveur et leur goût aux vins et alcools. Au plan de l’évolution, la séquence du génome du chêne permet d'ores et déjà aux chercheurs d’analyser plus finement les processus d’adaptation locale et de spéciation qui expliquent la diversité de ces arbres qui ont colonisés des milieux très diversifiés.

Ces travaux constituent une avancée majeure dans la connaissance de la biologie, de la génétique et de l’évolution des arbres, qui sera largement valorisée dans les recherches à venir portant sur la structure et le fonctionnement du génome de ces espèces pérennes. Au-delà de la connaissance académique, ces recherches ouvrent des perspectives dans des domaines plus appliqués, en réponse aux multiples questions sociétales portant sur l’évolution des forêts.

Des résultats partagés

Conformément aux accords internationaux des Bermudes (1998) et de Fort Lauderdale (2003), ainsi qu’à la déclaration de Toronto (2009), les données du séquençage du génome du chêne sont mises librement à disposition de la communauté scientifique (www.oakgenome.fr), avant la publication de l’article scientifique finalisé par le consortium prévue dans les prochains mois.

Projet GENOAK

Ce séquençage, l'assemblage et l'annotation du génome du chêne constitue un résultat du projet « GENOAK » (Séquençage du génome du chêne et identification de gènes d’intérêt adaptatifs chez les arbres forestiers), initié en octobre 2011, co-financé par l’Agence Nationale de la Recherche pour 4 ans et rassemblant plusieurs équipes de recherche de l’Inra ainsi que le Génoscope du CEA.

Contact(s)
Contact(s) scientifique(s) :

  • Christophe Plomion (05 57 12 27 65 ) Unité Biodiversité, Gènes et Communautés (Inra, Université de Bordeaux)
Contact(s) presse :
Inra service de presse (01 42 75 91 86), Yaël Kouzmine (Responsable communication Inra Bordeaux-Aquitaine) (06 75 91 37 65)
Département(s) associé(s) :
Écologie des forêts, prairies et milieux aquatiques
Centre(s) associé(s) :
Nouvelle-Aquitaine-Bordeaux

Référence

Decoding the oak genome: public release of sequence data, assembly, annotation and publication strategies, Christophe Plomion et al.

Molecular Ecology Resources, 6 mai 2015 (DOI: 10.1111/1755-0998.12425)